Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DFFAO00273 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DFFAO00273 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DFFAO00273 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DFFAO00273 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms