Protein–RNA interactions for Protein: F8WBC2

INMT-MINDY4, INMT-MINDY4 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INMT-MINDY4F8WBC2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
INMT-MINDY4F8WBC2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms