Protein–RNA interactions for Protein: F5GYI3

UBAP1L, Ubiquitin-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1LF5GYI3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBAP1LF5GYI3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.57■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBAP1LF5GYI3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms