Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR42E2A6NKP2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms