Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23AA6NH52 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23AA6NH52 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms