Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L4A6NCW7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L4A6NCW7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms