Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM89A2RUT3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM89A2RUT3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms