Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms