Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC091953.4-201ENST00000625179 341 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL133492.1-201ENST00000617854 3955 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 UBE2V1-206ENST00000415862 2387 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OXCT1-204ENST00000509987 1441 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NOX4-210ENST00000527956 2379 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MAGEE1-201ENST00000361470 3630 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AP3B2-209ENST00000542200 3921 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ALDH1L2-201ENST00000258494 7547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RAD54L-201ENST00000371975 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NCAM1-228ENST00000621128 4698 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DMD-209ENST00000378702 2617 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 EREG-201ENST00000244869 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF23-205ENST00000497160 2799 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NOP2-218ENST00000545200 2751 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLFN13-210ENST00000534689 3058 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DHDDS-202ENST00000360009 3245 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 COL21A1-212ENST00000535941 3369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 EPHA5-206ENST00000622150 8421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF780A-201ENST00000340963 3674 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NFYA-201ENST00000341376 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NUDT13-201ENST00000349051 1835 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SIPA1L2-203ENST00000366630 6690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC120114.2-201ENST00000567795 2272 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL358473.1-202ENST00000458003 3496 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FCN1-202ENST00000616356 4369 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 GPRASP2-201ENST00000332262 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ENTPD7-201ENST00000370489 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00298-201ENST00000426969 2236 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC6A15-211ENST00000552192 2221 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MYEF2-202ENST00000324324 10360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 BMS1P4-203ENST00000580790 1913 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 EXOC7-202ENST00000335146 3519 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 TAGAP-201ENST00000326965 3051 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC023154.1-203ENST00000508813 2465 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01845-201ENST00000518418 2012 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AL049776.1-201ENST00000624600 2025 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 PLEK-201ENST00000234313 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02239-201ENST00000504339 2290 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 C3P1-202ENST00000497718 4954 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 NTNG2-201ENST00000372179 3984 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms