Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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PTCH1Q13635 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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PTCH1Q13635 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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PTCH1Q13635 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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PTCH1Q13635 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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PTCH1Q13635 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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PTCH1Q13635 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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PTCH1Q13635 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
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