Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 ACTBP6-201ENST00000520036 1090 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 SLC44A3-AS1-212ENST00000532087 670 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL383P-201ENST00000581587 294 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PCDH18-206ENST00000611581 819 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 TEX46-203ENST00000622840 479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC007241.1-201ENST00000634531 933 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 SPATA31E1-201ENST00000325643 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 RPS6KB1-201ENST00000225577 5375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC114490.2-201ENST00000487874 3099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC011199.1-201ENST00000625022 3362 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 SYT2-202ENST00000367268 7598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 TIAM2-206ENST00000456877 3275 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC006330.1-201ENST00000624598 1987 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 LSM3-201ENST00000306024 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PPIP5K1-202ENST00000348806 5433 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A8-201ENST00000311438 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN14-206ENST00000372164 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 TECPR2-203ENST00000558678 4281 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 HADHAP2-201ENST00000540341 2285 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 OR3A4P-201ENST00000323164 1624 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PTPN20-204ENST00000374346 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 LINC01254-202ENST00000567609 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 ACTG1P9-201ENST00000457622 2658 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 S100A2-204ENST00000368710 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 HLA-DQA1-202ENST00000374949 1060 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 CCL21-202ENST00000378792 599 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AP000346.1-201ENST00000390329 1087 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 IL6-205ENST00000406575 649 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 LYG2-202ENST00000409238 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 RPL10P11-201ENST00000414541 616 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC004129.1-201ENST00000417617 796 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC111152.1-201ENST00000421447 693 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AL157395.1-201ENST00000427630 438 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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ATXN8OSP0DMR3 RPL13AP6-201ENST00000430133 612 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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ATXN8OSP0DMR3 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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ATXN8OSP0DMR3 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 SPIDR-205ENST00000518060 482 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 RANBP20P-201ENST00000557256 2104 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 IGKV2D-40-202ENST00000560045 312 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC145207.7-201ENST00000580125 958 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC069061.1-201ENST00000580677 397 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 IGKV2-40-202ENST00000621595 312 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC073592.9-201ENST00000624885 371 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 TTC33-205ENST00000636106 2252 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PRR23D2-201ENST00000528972 1587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PRR23D1-201ENST00000533250 1587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC048338.1-201ENST00000535844 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 LINC01555-201ENST00000370624 2884 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PHACTR3-209ENST00000541461 2349 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 ZNF391-201ENST00000244576 4079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 AC012613.2-201ENST00000523176 4533 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 CLU-201ENST00000316403 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PROX2-201ENST00000556084 3359 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 TACC2-203ENST00000358010 3815 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 LGMNP1-201ENST00000441282 1300 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 PEX2-206ENST00000522527 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ATXN8OSP0DMR3 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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