Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 KDM5D-210ENST00000541639 5579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 MYO6-204ENST00000369985 8575 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 BDNF-201ENST00000314915 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 HFE-207ENST00000357618 5286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 MMAA-201ENST00000281317 7068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 NYAP2-201ENST00000272907 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 MTR-205ENST00000535889 10405 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
XIRP2A4UGR9 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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