Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CPB1-201ENST00000282957 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SNORA70I-201ENST00000384544 135 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 VDAC1P8-201ENST00000406025 853 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PRMT8-203ENST00000452611 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ATP1B3-202ENST00000462082 837 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC026111.1-201ENST00000551090 1195 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RBM22P13-201ENST00000569805 1244 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC012557.3-201ENST00000626439 255 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CDYLP1-201ENST00000419017 1458 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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