Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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SNX13Q9Y5W8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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SNX13Q9Y5W8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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SNX13Q9Y5W8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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SNX13Q9Y5W8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SNX13Q9Y5W8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SNX13Q9Y5W8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SNX13Q9Y5W8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX13Q9Y5W8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SNX13Q9Y5W8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SNX13Q9Y5W8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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