Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPS5Q9UPZ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms