Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD4AQ9UPU9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms