Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms