Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PADI1Q9ULC6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PADI1Q9ULC6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms