Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCF2Q9UG63 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms