Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms