Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR4Q9NYA4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR4Q9NYA4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR4Q9NYA4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR4Q9NYA4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR4Q9NYA4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR4Q9NYA4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR4Q9NYA4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms