Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms