Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD3Q9NX63 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms