Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN6Q9NWW5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms