Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC39A9Q9NUM3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC39A9Q9NUM3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms