Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms