Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF275Q9NSD4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms