Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL1Q9NSC2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms