Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA4L2Q9NRX3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA4L2Q9NRX3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms