Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP4Q9NRJ4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms