Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DUOX1Q9NRD9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms