Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO8Q9NRD0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FBXO8Q9NRD0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms