Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPHNQ9NQX3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms