Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASCL3Q9NQ33 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms