Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRM3Q9NNZ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRM3Q9NNZ6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms