Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ELP3Q9H9T3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELP3Q9H9T3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms