Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKRIP1Q9H875 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKRIP1Q9H875 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms