Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHARPINQ9H0F6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms