Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC90BQ9GZT6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC90BQ9GZT6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms