Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLIRPQ9GZT3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLIRPQ9GZT3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms