Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE41Q9C0J9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE41Q9C0J9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms