Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRCC1Q9C099 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRCC1Q9C099 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms