Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM8Q9BZR9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM8Q9BZR9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM8Q9BZR9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM8Q9BZR9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM8Q9BZR9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM8Q9BZR9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM8Q9BZR9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM8Q9BZR9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms