Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI1

IRX2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX2Q9BZI1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRX2Q9BZI1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX2Q9BZI1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms