Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIH1Q9BYX4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms