Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPATA16Q9BXB7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms