Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC106Q9BWC9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms