Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC32Q9BV29 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms