Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF23Q9BUL5 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF23Q9BUL5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms