Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3BQ9BS92 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms